Boj s pandémiou podľa Matoviča zatiaľ zvládame, nevyčnievame spomedzi okolitých krajín, no mohlo to byť lepšie. Z pohľadu počtu obetí a ekonomických dôsledkov však hovorí o zbytočných škodách. Tvrdí, že vždy počúval názory odborníkov a tí podľa jeho slov radili zatvoriť školy teraz. Nepristúpenie k tomuto kroku označil za chybu. Skonštatoval, že máme dvakrát viac pozitívnych medzi školopovinnými deťmi ako inde. Školy označil za "semenište covidu".
Kritizoval pritom koaličnú SaS, ktorá podľa jeho slov zatvorenie škôl vetovala. "My sme tým pádom nemohli ani hlasovať, lebo hrozili, že odídu z koalície," podotkol. Negatívne vníma aj to, že sa ustúpilo z opatrení a deti nemuseli nosiť v škole rúška. Hovorí o nezodpovednom rozhodnutí. Na otázku, či sa školy plošne od nového roka zatvoria, odpovedal, že nechce predbiehať.
Čo sa týka očkovania, na Slovensku sa podľa Matoviča šírili bludy a "prehrali sme súboj s Robertom Ficom (Smer-SD)". Opozíciu kritizoval za to, že veľmi nepomohla motivácii na očkovanie. Okrem Fica spomenul aj lídra Hlasu-SD Petra Pellegriniho i predsedu ĽSNS Mariana Kotlebu. Aktuálne považuje za potrebné získať pre očkovanie ľudí, ktorí "podľahli bludom". Podotkol tiež, že motivovať k očkovaniu bolo a je najmä úlohou ministerstva zdravotníctva.
Opätovne pritom kritizoval ministra zdravotníctva Vladimíra Lengvarského (nominant OĽANO). Podľa slov Matoviča si teraz musí minister zožať, čo zasial. Nemyslí si, že by bolo dobré meniť šéfa rezortu počas vrcholu tretej vlny pandémie. Opakovane uviedol, že exminister Marek Krajčí (OĽANO) zvládal pandémiu lepšie. Na jeho návrat by však podľa neho nebola politická vôľa.